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Alois Niederschweiberer studierte von 1976 bis 1983 Humanmedizin an der Ludwig-Maximilians-Universität München. Seine Facharztweiterbildung absolvierte er an der Neurologischen Klinik des Universitätsklinikums der TU München, an der Fachklinik für Psychiatrie in Gauting sowie am Salzach-Klinikum Wasserburg und wurde 1991 Facharzt für Neurologie, Psychiatrie und Psychotherapie. Er promovierte zum Thema ambulantes Qualitätsmanagement bei psychotischen Erkrankungen und gründete 1992 seine eigene Praxis. Zu seinen Schwerpunkten zählen Depressionen, Angst- und Panikstörungen, Anpassungs- und Belastungsstörungen, familiäre und berufliche Krisen, Stress und Burn-out, Psychosen, Kopfschmerzen, Demenz sowie cerebrovaskuläre Erkrankungen.
Alois Niederschweiberer ist verheiratet und Vater von zwei Kindern.